蛋白質(zhì)N-糖基化修飾及其研究的意義
蛋白質(zhì) N-糖基化修飾在生物體中非常重要,蛋白質(zhì)N-糖基化修飾影響蛋白質(zhì)折疊、穩(wěn)定性、細(xì)胞定位、受體-配體相互作用等。它的研究也一直是蛋白質(zhì)組學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)與疾病機(jī)制研究的熱點(diǎn)。N-糖基化研究能解釋“為什么同一個(gè)蛋白在不同情況下功能不同": 同一種蛋白,即使氨基酸序列相同,N-糖基化位點(diǎn)的占據(jù)率與糖型組成仍會(huì)隨細(xì)胞狀態(tài)變化而變化。蛋白質(zhì)N-糖基化修飾對(duì)疾病機(jī)制與生物標(biāo)志物開發(fā)尤為關(guān)鍵:N-糖基化與多種疾病密切相關(guān):
? 癌癥:腫瘤常伴隨糖基化加工失衡,出現(xiàn)糖型重塑,影響腫瘤生長、侵襲、免疫逃逸。
? 免疫疾病:糖型改變會(huì)影響免疫細(xì)胞受體功能與免疫識(shí)別。
? 遺傳與罕見病:糖基化通路酶或轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)基因異常會(huì)導(dǎo)致廣泛的蛋白錯(cuò)誤折疊與功能缺陷。
? 感染與炎癥:病原體與宿主之間的糖識(shí)別、炎癥信號(hào)都可能涉及 N-糖基化變化。
如何進(jìn)行蛋白質(zhì)N-糖基化修飾研究
蛋白質(zhì) N-糖基化(N-glycosylation) 的研究通常要覆蓋:位點(diǎn)鑒定→ 糖型(結(jié)構(gòu))分析 → 蛋白表達(dá)(折疊/表達(dá)/定位/穩(wěn)定性等)→ 功能或通路驗(yàn)證。目前常用的驗(yàn)證策略如下
1) 設(shè)計(jì)突變
對(duì)目標(biāo)位點(diǎn)的 Asn進(jìn)行突變,做至少三組:WT(野生型)、單突變(每個(gè)位點(diǎn)各自)、多位點(diǎn)突變/組合突變(如果多個(gè)位點(diǎn)貢獻(xiàn)疊加)。
2) N-糖基化對(duì)蛋白質(zhì)表達(dá)的影響
n 表達(dá)量(Western/ELISA/流式)
n 蛋白穩(wěn)定性(Cycloheximide追蹤或蛋白半衰期)
n 亞細(xì)胞定位(免疫熒光/流式表面染色/分級(jí)提取)
n 整體折疊狀態(tài)(必要時(shí)做構(gòu)象抗體或SEC/DSF)
3) 根據(jù)你的蛋白功能選擇合適功能實(shí)驗(yàn),例如:
n 酶活(底物底物法)
n 受體/配體結(jié)合(SPR/BLI/共沉淀)
n 信號(hào)通路激活(報(bào)告基因 )
n 運(yùn)輸/分泌(分泌量、細(xì)胞表面水平)
n 細(xì)胞表型(增殖、遷移、凋亡等;最好回到分子層面)
4) 抑制糖基化或者類型
n 抑制糖鏈合成/轉(zhuǎn)移:使 N-糖基化整體減少或改變
n 抑制特定糖基化酶:例如巖藻糖轉(zhuǎn)移酶等
n 抑制加工(ER→Golgi):改變糖型成熟度
案例分享——PD-1
1. PD-1是高度糖基化修飾的蛋白質(zhì)
PD-1(Programmed cell death-1,程序性死亡受體1)是腫瘤免疫治療中最核心的免疫檢查點(diǎn)之一。PD-1是一種表達(dá)在免疫細(xì)胞表面的抑制性免疫檢查點(diǎn)受體。它的主要作用是幫助機(jī)體在免疫反應(yīng)過強(qiáng)時(shí)“剎車",維持免疫穩(wěn)態(tài);但在腫瘤中,PD-1 通路會(huì)被利用來讓腫瘤逃避免疫清除。研究發(fā)現(xiàn),PD-1 在 N49、N58、N74 和 N116 位置發(fā)生 N-連接糖基化,這一過程由糖基轉(zhuǎn)移酶 B3GNT2 促進(jìn)。此外,PD-1 的核心巖藻糖糖基化發(fā)生在 N49 和 N74 位點(diǎn),由核心巖藻糖糖基轉(zhuǎn)移酶 FUT8 介導(dǎo)。此外,PD-1 在 T153、S157、S159 和 T168 位點(diǎn)發(fā)生 O-連接糖基化。

圖1 PD-1 的糖基化和巖藻糖化調(diào)控的示意圖
2. N-糖基化修飾對(duì)PD-1的影響研究案例
盡管使用單克隆抗體進(jìn)行PD-1 阻斷治療在臨床上取得了成功,但大多數(shù)患者對(duì)這種治療沒有反應(yīng),而PD-1 的潛在調(diào)節(jié)機(jī)制仍未wan全明確。
作者通過突變、功能實(shí)驗(yàn)等,表明 PD-1在T細(xì)胞中廣泛進(jìn)行N-糖基化,并且其特定糖型的強(qiáng)度在TCR 激活后會(huì)發(fā)生變化;糖基化對(duì)于維持 PD-1 蛋白的穩(wěn)定性和細(xì)胞表面定位至關(guān)重要;PD-1的糖基化,尤其是 N58 位點(diǎn)的糖基化,對(duì)于介導(dǎo)其與 PD-L1的相互作用是bi不可少的。
此外作者基于目前PD-1靶向治療的局限性,設(shè)計(jì)單克隆抗體 STM418 特異性靶向糖基化的PD-1,其與PD-1 的結(jié)合親和力高于已獲批的PD-1抗體,能有效抑制PD-L1/PD-1結(jié)合,并增強(qiáng)抗腫瘤免疫反應(yīng)。這些研究結(jié)果共同揭示了PD-1葡糖基化的功能意義,并為將葡糖基化的PD-1作為免疫治療潛在策略加以靶向提供了理論依據(jù)。文章整體設(shè)計(jì)及結(jié)果如下所示:

圖2 文章設(shè)計(jì)及結(jié)果總結(jié)

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